2019年02月，中国国家卫健委在全国范围内遴选罕见病诊疗能力较强、诊疗病例较多的324家医院组建罕见病诊疗协作网，包括1家国家级牵头医院：中国医学科学院北京协和医院、32家省级牵头医院以及291家成员医院。
第一批罕见病诊疗协作网医院名单
| 编号 | 省份 | 类型 | 协作网医院 |
| 1 | 北京市 | 国家级牵头医院 | 中国医学科学院北京协和医院 |
| 2 | 北京市 | 省级牵头医院 | 北京大学第一医院 |
| 3 | 成员医院 | 北京医院 | |
| 4 | 中日友好医院 | ||
| 5 | 中国医学科学院阜外医院 | ||
| 6 | 北京大学人民医院 | ||
| 7 | 北京大学第三医院 | ||
| 8 | 中国人民解放军总医院 | ||
| 9 | 首都医科大学宣武医院 | ||
| 10 | 首都医科大学附属北京友谊医院 | ||
| 11 | 首都医科大学附属北京朝阳医院 | ||
| 12 | 首都医科大学附属北京天坛医院 | ||
| 13 | 首都医科大学附属北京儿童医院 | ||
| 14 | 首都儿科研究所附属儿童医院 | ||
| 15 | 北京积水潭医院 | ||
| 16 | 天津市 | 省级牵头医院 | 天津医科大学总医院 |
| 17 | 成员医院 | 中国医学科学院血液病医院 | |
| 18 | 天津市第一中心医院 | ||
| 19 | 天津市第三中心医院 | ||
| 20 | 天津市第五中心医院 | ||
| 21 | 天津市儿童医院 | ||
| 22 | 天津市肿瘤医院 | ||
| 23 | 天津医科大学第二医院 | ||
| 24 | 天津中医药大学第一附属医院 | ||
| 25 | 天津市中西医结合医院（南开医院） | ||
| 26 | 河北省 | 省级牵头医院 | 河北医科大学第二医院 |
| 27 | 成员医院 | 河北医科大学第三医院 | |
| 28 | 河北省人民医院 | ||
| 29 | 河北省儿童医院 | ||
| 30 | 保定市第一中心医院 | ||
| 31 | 河北大学附属医院 | ||
| 32 | 沧州市中心医院 | ||
| 33 | 衡水市人民医院（哈励逊国际和平医院） | ||
| 34 | 邯郸市中心医院 | ||
| 35 | 河北北方学院附属第一医院 | ||
| 36 | 唐山市工人医院 | ||
| 37 | 邢台市人民医院 | ||
| 38 | 山西省 | 省级牵头医院 | 山西医科大学第一医院 |
| 39 | 成员医院 | 山西省人民医院 | |
| 40 | 山西医科大学第二医院 | ||
| 41 | 山西大医院 | ||
| 42 | 山西省儿童医院 | ||
| 43 | 山西省心血管病医院 | ||
| 44 | 山西省眼科医院 | ||
| 45 | 太原市第三人民医院 | ||
| 46 | 临汾市人民医院 | ||
| 47 | 长治医学院附属和平医院 | ||
| 48 | 内蒙古自治区 | 省级牵头医院 | 内蒙古医科大学附属医院 |
| 49 | 成员医院 | 内蒙古自治区人民医院 | |
| 50 | 内蒙古自治区妇幼保健院 | ||
| 51 | 巴彦淖尔市医院 | ||
| 52 | 包头市中心医院 | ||
| 53 | 包头医学院第一附属医院 | ||
| 54 | 赤峰市医院 | ||
| 55 | 赤峰学院附属医院 | ||
| 56 | 通辽市医院 | ||
| 57 | 兴安盟人民医院 | ||
| 58 | 辽宁省 | 省级牵头医院 | 中国医科大学附属第一医院 |
| 59 | 成员医院 | 中国医科大学附属盛京医院 | |
| 60 | 中国医科大学附属第四医院 | ||
| 61 | 辽宁省人民医院 | ||
| 62 | 辽宁中医药大学附属医院 | ||
| 63 | 北部战区总医院 | ||
| 64 | 大连医科大学附属第一医院 | ||
| 65 | 大连医科大学附属第二医院 | ||
| 66 | 大连市中心医院 | ||
| 67 | 鞍山市中心医院 | ||
| 68 | 锦州医科大学附属第一医院 | ||
| 69 | 吉林省 | 省级牵头医院 | 吉林大学第一医院 |
| 70 | 成员医院 | 吉林大学第二医院 | |
| 71 | 长春市中心医院 | ||
| 72 | 长春市儿童医院 | ||
| 73 | 吉林市人民医院 | ||
| 74 | 吉林市中心医院 | ||
| 75 | 白城中心医院 | ||
| 76 | 白山市中心医院 | ||
| 77 | 辽源市中心医院 | ||
| 78 | 四平市中心医院 | ||
| 79 | 松原市中心医院 | ||
| 80 | 通化市中心医院 | ||
| 81 | 延边大学附属医院 | ||
| 82 | 黑龙江省 | 省级牵头医院 | 哈尔滨医科大学附属第一医院 |
| 83 | 成员医院 | 哈尔滨医科大学附属第二医院 | |
| 84 | 黑龙江省医院 | ||
| 85 | 哈尔滨市儿童医院 | ||
| 86 | 大庆油田总医院 | ||
| 87 | 大兴安岭地区人民医院 | ||
| 88 | 鹤岗市人民医院 | ||
| 89 | 鸡西鸡矿医院 | ||
| 90 | 佳木斯市中心医院 | ||
| 91 | 牡丹江市第一人民医院 | ||
| 92 | 齐齐哈尔市第一医院 | ||
| 93 | 绥化市第一医院 | ||
| 94 | 伊春市中心医院 | ||
| 95 | 上海市 | 省级牵头医院 | 上海交通大学医学院附属新华医院 |
| 96 | 成员医院 | 复旦大学附属中山医院 | |
| 97 | 复旦大学附属华山医院 | ||
| 98 | 复旦大学附属妇产科医院 | ||
| 99 | 复旦大学附属儿科医院 | ||
| 100 | 上海交通大学医学院附属瑞金医院 | ||
| 101 | 上海交通大学医学院附属仁济医院 | ||
| 102 | 上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心 | ||
| 103 | 上海市儿童医院 | ||
| 104 | 上海长海医院 | ||
| 105 | 上海长征医院 | ||
| 106 | 江苏省 | 省级牵头医院 | 东部战区总医院 |
| 107 | 成员医院 | 东南大学附属中大医院 | |
| 108 | 江苏省人民医院 | ||
| 109 | 南京鼓楼医院 | ||
| 110 | 南京脑科医院 | ||
| 111 | 南京市儿童医院 | ||
| 112 | 苏州大学附属第一医院 | ||
| 113 | 苏州大学附属儿童医院 | ||
| 114 | 扬州大学附属医院 | ||
| 115 | 无锡市人民医院 | ||
| 116 | 徐州医科大学附属医院 | ||
| 117 | 徐州市中心医院 | ||
| 118 | 淮安市第一人民医院 | ||
| 119 | 浙江省 | 省级牵头医院 | 浙江大学医学院附属第二医院 |
| 120 | 成员医院 | 浙江大学医学院附属第一医院 | |
| 121 | 浙江大学医学院附属儿童医院 | ||
| 122 | 浙江大学医学院附属邵逸夫医院 | ||
| 123 | 浙江省人民医院 | ||
| 124 | 浙江省中医院 | ||
| 125 | 浙江省肿瘤医院 | ||
| 126 | 宁波市第一医院 | ||
| 127 | 温州医科大学附属第一医院 | ||
| 128 | 温州医科大学附属第二医院 | ||
| 129 | 温州医科大学附属眼视光医院 | ||
| 130 | 浙江省台州医院 | ||
| 131 | 安徽省 | 省级牵头医院 | 安徽医科大学第一附属医院 |
| 132 | 成员医院 | 中国科学技术大学附属第一医院（安徽省立医院） | |
| 133 | 安徽医科大学第二附属医院 | ||
| 134 | 安徽中医学院第一附属医院（安徽省中医院） | ||
| 135 | 安徽省第二人民医院 | ||
| 136 | 安徽省儿童医院 | ||
| 137 | 安徽省胸科医院 | ||
| 138 | 蚌埠医学院第一附属医院 | ||
| 139 | 淮北市人民医院 | ||
| 140 | 六安市人民医院 | ||
| 141 | 皖南医学院第一附属医院（弋矶山医院） | ||
| 142 | 福建省 | 省级牵头医院 | 福建医科大学附属第一医院 |
| 143 | 成员医院 | 福建医科大学附属协和医院 | |
| 144 | 福建省立医院 | ||
| 145 | 福建医科大学附属福州市第一医院 | ||
| 146 | 厦门大学附属第一医院 | ||
| 147 | 厦门大学附属中山医院 | ||
| 148 | 厦门市儿童医院 | ||
| 149 | 福建省南平市第一医院 | ||
| 150 | 龙岩市第一医院 | ||
| 151 | 宁德市医院 | ||
| 152 | 莆田学院附属医院 | ||
| 153 | 泉州市第一医院 | ||
| 154 | 三明市第一医院 | ||
| 155 | 漳州市医院 | ||
| 156 | 江西省 | 省级牵头医院 | 南昌大学第一附属医院 |
| 157 | 成员医院 | 南昌大学第二附属医院 | |
| 158 | 江西省儿童医院 | ||
| 159 | 抚州市第一人民医院 | ||
| 160 | 赣南医学院第一附属医院 | ||
| 161 | 吉安市中心人民医院 | ||
| 162 | 九江市第一人民医院 | ||
| 163 | 萍乡市人民医院 | ||
| 164 | 上饶市人民医院 | ||
| 165 | 新余市人民医院 | ||
| 166 | 宜春市人民医院 | ||
| 167 | 鹰潭市人民医院 | ||
| 168 | 山东省 | 省级牵头医院 | 山东省立医院 |
| 169 | 成员医院 | 山东大学齐鲁医院 | |
| 170 | 山东大学齐鲁儿童医院(济南市儿童医院) | ||
| 171 | 济南市妇幼保健院 | ||
| 172 | 济南市中心医院 | ||
| 173 | 山东省千佛山医院 | ||
| 174 | 青岛大学附属医院 | ||
| 175 | 青岛市人民医院 | ||
| 176 | 济宁市第一人民医院 | ||
| 177 | 聊城市人民医院 | ||
| 178 | 临沂市人民医院 | ||
| 179 | 泰山医学院附属医院 | ||
| 180 | 烟台毓璜顶医院 | ||
| 181 | 山东省医学科学院附属医院 | ||
| 182 | 河南省 | 省级牵头医院 | 郑州大学第一附属医院 |
| 183 | 成员医院 | 郑州大学第二附属医院 | |
| 184 | 郑州大学第三附属医院 | ||
| 185 | 郑州大学第五附属医院 | ||
| 186 | 河南省儿童医院 | ||
| 187 | 河南省人民医院 | ||
| 188 | 河南省胸科医院 | ||
| 189 | 河南大学淮河医院 | ||
| 190 | 河南科技大学第一附属医院 | ||
| 191 | 新乡医学院第一附属医院 | ||
| 192 | 新乡医学院第三附属医院 | ||
| 193 | 湖北省 | 省级牵头医院 | 华中科技大学同济医学院附属同济医院 |
| 194 | 成员医院 | 华中科技大学同济医学院附属协和医院 | |
| 195 | 武汉大学人民医院 | ||
| 196 | 武汉大学中南医院 | ||
| 197 | 武汉市中心医院 | ||
| 198 | 武汉市第一医院 | ||
| 199 | 武汉儿童医院 | ||
| 200 | 荆州市中心医院 | ||
| 201 | 十堰市太和医院 | ||
| 202 | 襄阳市中心医院 | ||
| 203 | 宜昌市中心人民医院 | ||
| 204 | 湖南省 | 省级牵头医院 | 中南大学湘雅医院 |
| 205 | 成员医院 | 中南大学湘雅二医院 | |
| 206 | 中南大学湘雅三医院 | ||
| 207 | 湖南省人民医院 | ||
| 208 | 湖南省儿童医院 | ||
| 209 | 湖南省妇幼保健院 | ||
| 210 | 长沙市中心医院 | ||
| 211 | 怀化市第一人民医院 | ||
| 212 | 岳阳市一人民医院 | ||
| 213 | 株洲市中心医院 | ||
| 214 | 广东省 | 省级牵头医院 | 广州市妇女儿童医疗中心 |
| 215 | 成员医院 | 中山大学附属第一医院 | |
| 216 | 中山大学附属第三医院 | ||
| 217 | 中山大学中山眼科中心 | ||
| 218 | 中山大学孙逸仙纪念医院 | ||
| 219 | 广东省人民医院 | ||
| 220 | 中国人民解放军南部战区总医院 | ||
| 221 | 广州医科大学附属第一医院 | ||
| 222 | 广州医科大学附属第三医院 | ||
| 223 | 南方医科大学南方医院 | ||
| 224 | 南方医科大学珠江医院 | ||
| 225 | 深圳市儿童医院 | ||
| 226 | 深圳市妇幼保健院 | ||
| 227 | 汕头大学医学院第一附属医院 | ||
| 228 | 广西壮族自治区 | 省级牵头医院 | 广西医科大学第一附属医院 |
| 229 | 成员医院 | 广西壮族自治区人民医院 | |
| 230 | 广西壮族自治区妇幼保健院 | ||
| 231 | 广西中医药大学附属瑞康医院 | ||
| 232 | 桂林医学院附属医院 | ||
| 233 | 柳州市工人医院 | ||
| 234 | 钦州市第一人民医院 | ||
| 235 | 梧州市工人医院 | ||
| 236 | 右江民族医学院附属医院 | ||
| 237 | 玉林市第一人民医院 | ||
| 238 | 海南省 | 省级牵头医院 | 海南省人民医院 |
| 239 | 成员医院 | 海南医学院第一附属医院 | |
| 240 | 海南医学院第二附属医院 | ||
| 241 | 海南省妇幼保健院 | ||
| 242 | 海口市人民医院 | ||
| 243 | 儋州市人民医院 | ||
| 244 | 琼海市人民医院 | ||
| 245 | 重庆市 | 省级牵头医院 | 重庆医科大学附属第一医院 |
| 246 | 成员医院 | 重庆医科大学附属第二医院 | |
| 247 | 重庆医科大学附属儿童医院 | ||
| 248 | 重庆市人民医院 | ||
| 249 | 陆军军医大学第一附属医院（西南医院） | ||
| 250 | 陆军军医大学第二附属医院（新桥医院） | ||
| 251 | 陆军军医大学第三附属医院（大坪医院） | ||
| 252 | 重庆三峡中心医院 | ||
| 253 | 重庆市涪陵中心医院 | ||
| 254 | 重庆市黔江中心医院 | ||
| 255 | 重庆市中医院 | ||
| 256 | 四川省 | 省级牵头医院 | 四川大学华西医院 |
| 257 | 成员医院 | 四川大学华西第二医院 | |
| 258 | 四川省人民医院 | ||
| 259 | 成都市第三人民医院 | ||
| 260 | 德阳市人民医院 | ||
| 261 | 攀枝花市中心医院 | ||
| 262 | 遂宁市中心医院 | ||
| 263 | 西南医科大学附属医院 | ||
| 264 | 宜宾市第一人民医院 | ||
| 265 | 自贡市第一人民医院 | ||
| 266 | 贵州省 | 省级牵头医院 | 贵州医科大学附属医院 |
| 267 | 成员医院 | 贵州省人民医院 | |
| 268 | 贵阳市第二人民医院 | ||
| 269 | 贵航贵阳医院 | ||
| 270 | 毕节市第一人民医院 | ||
| 271 | 黔西南州人民医院 | ||
| 272 | 铜仁市人民医院 | ||
| 273 | 遵义医学院附属医院 | ||
| 274 | 云南省 | 省级牵头医院 | 昆明医科大学第一附属医院 |
| 275 | 成员医院 | 昆明医科大学第二附属医院 | |
| 276 | 云南省肿瘤医院 | ||
| 277 | 云南省第一人民医院 | ||
| 278 | 云南省第二人民医院 | ||
| 279 | 云南省阜外心血管病医院 | ||
| 280 | 昆明市第一人民医院 | ||
| 281 | 昆明市儿童医院 | ||
| 282 | 曲靖市第一人民医院 | ||
| 283 | 玉溪市人民医院 | ||
| 284 | 西藏自治区 | 省级牵头医院 | 西藏自治区人民医院 |
| 285 | 成员医院 | 西藏自治区第二人民医院 | |
| 286 | 那曲地区人民医院 | ||
| 287 | 陕西省 | 省级牵头医院 | 西安交通大学第一附属医院 |
| 288 | 成员医院 | 西安交通大学第二附属医院 | |
| 289 | 陕西省人民医院 | ||
| 290 | 空军军医大学第一附属医院（西京医院） | ||
| 291 | 空军军医大学第二附属医院（唐都医院） | ||
| 292 | 西安市儿童医院 | ||
| 293 | 西北妇女儿童医院 | ||
| 294 | 甘肃省 | 省级牵头医院 | 甘肃省人民医院 |
| 295 | 成员医院 | 兰州大学第一医院 | |
| 296 | 兰州大学第二医院 | ||
| 297 | 青海省 | 省级牵头医院 | 青海省人民医院 |
| 298 | 成员医院 | 青海大学附属医院 | |
| 299 | 青海省妇女儿童医院 | ||
| 300 | 青海省心脑血管病专科医院 | ||
| 301 | 青海红十字医院 | ||
| 302 | 宁夏回族自治区 | 省级牵头医院 | 宁夏医科大学总医院 |
| 303 | 成员医院 | 宁夏回族自治区人民医院 | |
| 304 | 宁夏回族自治区第五人民医院 | ||
| 305 | 银川市第一人民医院 | ||
| 306 | 吴忠市人民医院 | ||
| 307 | 石嘴山市第一人民医院 | ||
| 308 | 石嘴山市第二人民医院 | ||
| 309 | 固原市人民医院 | ||
| 310 | 中卫市人民医院 | ||
| 311 | 新疆维吾尔自治区 | 省级牵头医院 | 新疆维吾尔自治区人民医院 |
| 312 | 成员医院 | 新疆医科大学第一附属医院 | |
| 313 | 阿克苏地区第一人民医院 | ||
| 314 | 昌吉回族自治州人民医院 | ||
| 315 | 喀什地区第一人民医院 | ||
| 316 | 伊犁州友谊医院 | ||
| 317 | 新疆生产建设兵团 | 省级牵头医院 | 石河子大学医学院第一附属医院 |
| 318 | 成员医院 | 新疆生产建设兵团医院 | |
| 319 | 新疆生产建设兵团第一师医院 | ||
| 320 | 新疆生产建设兵团第一师阿拉尔医院 | ||
| 321 | 新疆生产建设兵团第四师医院 | ||
| 322 | 新疆生产建设兵团第七师医院 | ||
| 323 | 石河子市人民医院 | ||
| 324 | 第十师北屯市北屯医院 |
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